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一種Fmoc保護(hù)試劑:Fmoc-Amox
分類 :新聞
發(fā)布時(shí)間 :2022/09/30
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大多數(shù)肽的合成是通過采用Fmoc或Boc保護(hù)方法的固相肽合成來實(shí)現(xiàn)的,然而在使用Fmoc-OSu時(shí),由于二肽(或三肽)和β-丙氨酰胺雜質(zhì)的形成,在氨基酸中未受保護(hù)的N引入Fmoc似乎具有挑戰(zhàn)性。在此介紹一種基于肟的衍生物Fmoc-Amox合成Fmoc-Gly-OH的有效方法,且沒有任何副反應(yīng)。Fmoc-Amox價(jià)格低廉,并且Amox在反應(yīng)后可以很容易地去除,從而提供不含任何有害雜質(zhì)或污染物(主要是二肽或Amox本身)的純Fmoc-Gly-OH,這一點(diǎn)可以從高效液相色譜和核磁共振得到論證。

 

1963年,Merrifield描述了一種全新的化學(xué)合成概念,市場(chǎng)上有一些藥物的活性成分(API)是TIDES(寡核苷酸和肽治療劑),含有多達(dá)30-40個(gè)單體,這些單體是使用Merrifield首次描述的固相方法生產(chǎn)的。雖然一開始固相肽合成(SPPS)方法在某種程度上受到了他歐洲同事的質(zhì)疑,但目前此方法已經(jīng)廣泛應(yīng)用于合成研究及生產(chǎn)。

 

從命名可以看出,所有氨基酸至少有兩個(gè)官能團(tuán):一個(gè)羧酸和一個(gè)氨基。如果氨基酸C末端羧酸的活性被不溶性高分子基團(tuán)掩蓋、氨基被臨時(shí)保護(hù)起來,再逐步連續(xù)的參與反應(yīng),也包括脫除氨基的保護(hù)基團(tuán),然后與下一個(gè)N被保護(hù)的氨基酸進(jìn)行偶聯(lián)。然而,在三官能團(tuán)氨基酸的情況下,側(cè)鏈則被永久(或半永久)保護(hù)基團(tuán)所保護(hù)。早些年,Merrifield使用芐基 (Bn) 進(jìn)行長(zhǎng)期保護(hù),使用叔丁氧基羰基 (Boc)作為臨時(shí)保護(hù)基團(tuán),但是Boc和Bn都可以在酸性條件下分解:三氟乙酸(TFA)脫Boc、強(qiáng)酸如HF或三氟甲磺酸(TFMSA)水解Bn。在70年代,同樣提出過Boc保護(hù)基團(tuán)的Carpino,通過提出芴基甲氧羰基(Fmoc)作為臨時(shí)保護(hù)氨基的基團(tuán),徹底改變了肽化學(xué)領(lǐng)域,即可以使用堿脫除N保護(hù)基團(tuán),因而與Boc基團(tuán)正交。此外,歐洲的Sheppard和Atherton,與美國(guó)的Chang和 Meienhofer同時(shí)開發(fā)了Fmoc/t-Bu方法,反應(yīng)用TFA溶液處理后釋放出肽。該方法的實(shí)施標(biāo)志著肽合成的“平民化”,因?yàn)锽oc/Bn方法的使用需要訓(xùn)練有素的化學(xué)工作者和特殊設(shè)備,而通過Fmoc/t-Bu方法,其他生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室也能夠合成肽。此外,該方法已實(shí)現(xiàn)了生產(chǎn)公斤級(jí)肽。

 

最初商業(yè)化的Fmoc-氨基酸是用Schotten-Baumann方法合成:氨基酸與Fmoc-Cl在堿性條件下反應(yīng)(圖1A)。80年代早期,Ashish小組和Bachem、Goodman指出了大多數(shù)商業(yè)化Fmoc-氨基酸中包含二肽和三肽,這些雜質(zhì)來自Fmoc-Cl的高反應(yīng)性,它也可以與要保護(hù)的氨基酸的羧基反應(yīng)生成酸酐,酸酐又可以與另一個(gè)氨基酸分子的胺末端反應(yīng),導(dǎo)致形成二肽。機(jī)制如圖1B所示。

 

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圖1  氨基酸的Fmoc保護(hù)
A. Fmoc保護(hù)機(jī)制
B. 在氨基酸保護(hù)過程中形成受保護(hù)二肽的機(jī)制

 

考慮到即使是很小比例的雜質(zhì)也會(huì)導(dǎo)致收率和純度下降,因此雙方共同得出了避免使用 Fmoc-Cl的結(jié)論。由于這些副反應(yīng)與離去基團(tuán)的質(zhì)量有關(guān),Ashish小組建議使用Fmoc-N3,同樣Carpino 和Han在他們的論文中也有提到此觀點(diǎn)。Ashish小組提出了用Fmoc-Cl和疊氮化鈉合成Fmoc-N3,為了避免Fmoc-N3制備和存儲(chǔ)的危險(xiǎn)性,現(xiàn)做現(xiàn)用,該方法合成的Fmoc-氨基酸具有較高純度。Verlander等人通過篩選不同的離去基團(tuán),建議使用Fmoc-OSU,與此同時(shí),Bolin等人建議使用甲硅烷基化試劑保護(hù)羧基。多年后,Barlos等人提出了從Trt-Cl制備Trt-氨基酸的方法,以避免Trt酯類雜質(zhì)的生成。后來,Suresh等人提出在活化鋅粉存在下用Fmoc-Cl制備Fmoc-氨基酸,此方法允許在中性條件下進(jìn)行。

 

然而,長(zhǎng)期以來最常用的Fmoc-氨基酸合成方法是Fmoc-OSu(或 NHS),當(dāng)Hlebowicz等人對(duì)Fmoc-Cl制備Fmoc-氨基酸提出質(zhì)疑時(shí),該方法也受到了質(zhì)疑。Bachem Europe的研究表明,使用Fmoc-OSu制備的Fmoc-AA-OH中含有Fmoc-β-Ala-OH和Fmoc-β-Ala-AA-OH,這兩個(gè)雜質(zhì)是在OSu攻擊一個(gè)羰基后通過Lossen重排形成的(圖2)。

 

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圖2  β-丙氨酰胺通過Lossen重排的形成機(jī)制

 

這些發(fā)現(xiàn)再次激發(fā)了開發(fā)新試劑或安全引入Fmoc基團(tuán)方法的研究熱情。表1列出了用于保護(hù)氨基酸的不同F(xiàn)moc衍生物及其用于制備Fmoc-Gly-OH的結(jié)果,雖然這種反應(yīng)可以用于所有氨基酸的保護(hù),但Gly更明顯,因?yàn)樗牡臀蛔栌欣诟咝实木酆?。這些引入Fmoc的衍生物應(yīng)具有兩個(gè)關(guān)鍵特征:(i)無特殊高反應(yīng)性,避免低聚肽的形成;(ii)離去基團(tuán)通常是被氨基酸取代的羥基化合物,在處理過程中相對(duì)更容易去除。因此,Ashish小組首先提出了 Fmoc-2-巰基苯并咪唑,它合成的Fmoc衍生物中低聚肽較少(表1,#4)。然而,反應(yīng)中釋放的副產(chǎn)物2-MBT溶解度差,需要用有機(jī)溶劑洗滌才能完全去除,而Fmoc-氨基酸在有機(jī)溶劑中也有一定的溶解度,因此不利于最終產(chǎn)率。Verlander等人遇到了類似的問題,當(dāng)使用(多)氯苯基衍生物時(shí),有機(jī)溶劑醇污染了最終產(chǎn)品,導(dǎo)致總收率低(4-30%)。

 

其他琥珀酰亞胺的衍生物,例如鄰苯二甲酰亞胺、降冰片烯基(它是由降冰片烯衍生的自由基)和相應(yīng)的螺環(huán)類似物、六元衍生物等,也進(jìn)行了分析,但并不具有顯著優(yōu)勢(shì)(表1,#5-7)。同時(shí),當(dāng)降冰片烯基與EDC結(jié)合用于水中的固相肽合成 (SPPS) 時(shí),檢測(cè)到了β-丙氨酸的形成。為了克服使用琥珀酰亞胺衍生物導(dǎo)致β-丙氨酰胺殘基嵌入問題,Najera等人提出了一種聚合物形式的試劑,最終β-丙氨酰胺污染物是固定在聚合物載體上的,但這種方法限制了制備少量保護(hù)氨基酸的使用。

 

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通常與碳二亞胺偶聯(lián)化合物例如五氟苯基(Pfp)或苯并三唑(Bt)一起使用的其他活性物質(zhì),雖然這些試劑價(jià)格相對(duì)偏高(Pfp)或易爆(Bt)(表1、#8、9),但產(chǎn)率很高,有些實(shí)驗(yàn)室甚至研究了Fmoc-三嗪衍生物(表1,#10)作為一種合成Fmoc-氨基酸的方法。對(duì)于使用純水溶液引入Fmoc的方法,已使用Fmoc-苯基二甲基锍甲基硫酸鹽 (Fmoc-ODsp),但未研究是否有二肽的形成(表1,#11)。

 

為了克服肽結(jié)構(gòu)單元合成中的最大挑戰(zhàn)之一,即在氨基酸保護(hù)過程中不希望形成二肽和三肽,已經(jīng)深入研究了大量Fmoc離去基團(tuán)的方法。盡管少量試劑有還不錯(cuò)的結(jié)果,但基本沒有一種有潛力能應(yīng)用于工業(yè)化生產(chǎn)。在此方面,基于常用的碳二亞胺添加劑肟的結(jié)構(gòu),提出了Fmoc離去基團(tuán)衍生物Fmoc-Amox。Fmoc-Amox已用于保護(hù)極易產(chǎn)生副反應(yīng)的H-Gly-OH,有很高的收率 (93%) ,并且完全沒有Fmoc-二肽形式的副產(chǎn)物產(chǎn)生,這從 HPLC和NMR分析中得到印證。此外,Amox衍生物將來或許可用于引入其他保護(hù)基團(tuán),例如pNZ、Alloc和Boc。

 

Ashish小組認(rèn)為Oxyma是比碳二亞胺更優(yōu)秀的添加劑,Oxyma反應(yīng)性強(qiáng),在肽的工業(yè)化生產(chǎn)中的應(yīng)用越來越廣泛。小組也研究了其他反應(yīng)性較低的肟衍生物來引入Fmoc基團(tuán),從第一次篩選(表1,#12-16)中,包括2-羥基吡啶N-氧化物(HOPO),Oxyma衍生物(表1,#12)由于其高反應(yīng)性而得到含量較多的二肽,然后是HOPO(表1,#16)。氰基吡啶肟也是較好的添加劑(表1,#15),但其價(jià)格昂貴,而且很難從反應(yīng)中去除。第二次篩選得到的二肽形成量總體較少(表1,#17-20),因此選擇氰基酰胺衍生物(Amox)(表1,#20)作為替代 HOSu 以引入Fmoc。Fmoc-Amox價(jià)格適宜,并且在反應(yīng)后可以很容易地去除,這與MBT的情況不同,Amox 在水中的溶解度為0.9 M,這確保了它不會(huì)污染最終的Fmoc-氨基酸(表1,#4)。

 

在Fmoc-二肽形成方面,H-Gly-OH被證明是評(píng)估Fmoc-Amox性能的最佳試劑,因?yàn)槠涞涂臻g位阻有利于高比例的寡聚化。使用1克和40克兩種平行實(shí)驗(yàn)制備Fmoc-Gly-OH結(jié)果接近,反應(yīng)過程描述如下:將Fmoc-Amox的丙酮溶液緩慢加入到攪拌的H-Gly-OH和碳酸鈉水溶液中,通過連續(xù)分批添加碳酸鈉將反應(yīng)混合物的pH值保持在9-10。通過TLC以及pH穩(wěn)定性監(jiān)測(cè)反應(yīng)(pH的降低作為發(fā)生反應(yīng)的標(biāo)志)。反應(yīng)完成后(4小時(shí)),除去溶劑,剩余的水層用DCM洗滌,然后加入1N HCl(直到pH<2),得到灰白色沉淀,然后過濾沉淀物并使用乙酸乙酯和正己烷(93%)重結(jié)晶,HPLC檢測(cè)Fmoc-Gly-OH的純度非常好。由于通過固相技術(shù)制備的Fmoc-Gly-Gly-OH會(huì)與Fmoc-Gly-OH一起被洗脫出來,表明形成的二肽雜質(zhì)是難去除的,如圖 3所示,色譜圖中沒有觀察到二肽的痕跡(圖3)。此外,1H NMR 未顯示Amox存在任何污染(圖4),這清楚地表明Amox在合成Fmoc氨基酸方面有很大的優(yōu)勢(shì)。

 

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圖3  (A) Fmoc-Gly-OH和一同洗脫的Fmoc-Gly-Gly-OH的HPLC色譜圖
(B) Fmoc-Gly-OH的HPLC色譜圖

 

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圖4  Fmoc-Gly-OH、Fmoc-Amox和Amox的1H和13C NMR比較

 

在這些結(jié)果的推動(dòng)下,使用上述方法制備了Fmoc-Phe-OH和Fmoc-Val-OH(各10 g小試)(圖5和6)。最終產(chǎn)物的純度通過HPLC和NMR確認(rèn),沒有顯示二肽的微量形成。還研究了溶劑在后處理過程中的重要性,將所得產(chǎn)物溶解在DCM中并使用蒸餾水萃取,DCM后處理有助于去除微量的Amox,從而產(chǎn)生經(jīng)NMR證實(shí)的純品(圖 7)。

 

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圖5  (I)A. Fmoc-Phe-OH與Fmoc-Phe-Phe-OH一同洗脫的HPLC色譜圖
B. Fmoc-Phe-OH的 HPLC色譜圖
(II) Fmoc-Phe-OH、Fmoc-Amox和Amox的1H和13C NMR比較

 

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圖6  (I) A. Fmoc-Val-OH與Fmoc-Val-Val-OH一同洗脫的HPLC色譜圖
B. Fmoc-Val-OH的 HPLC色譜圖
(II) Fmoc-Val-OH、Fmoc-Amox和Amox的1H和13C NMR比較

 

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圖7  使用乙酸乙酯和DCM萃取Fmoc-Phe-OH的后處理比較

 

這些結(jié)果清楚地表明了Fmoc-Amox在合成最容易產(chǎn)生副反應(yīng)的Fmoc-氨基酸方面具有很大的優(yōu)越性。

 

Fmoc-氨基酸的合成實(shí)例:


1、將甘氨酸(131.34mmol)、碳酸鈉(106mmol)加到純化水中,滴加Fmoc-Amox(119.4mmol)的丙酮溶液,保證反應(yīng)液pH始終保持在9-10。待TLC檢測(cè)Fmoc-Amox反應(yīng)完全,將反應(yīng)液濃縮去除丙酮后用二氯甲烷萃取除雜,水相用1N HCl調(diào)酸,大量白色固體析出,過濾,濾餅用純化水洗三遍。收集固體用乙酸乙酯/正己烷重結(jié)晶,得到高純度的Fmoc-甘氨酸。

 

2、將苯丙氨酸或纈氨酸(33mmol)、碳酸鈉(75mmol)加到純化水中,滴加Fmoc-Amox(30mmol)的丙酮溶液,保證反應(yīng)液pH始終保持在9-10。待TLC檢測(cè)Fmoc-Amox反應(yīng)完全,將反應(yīng)液濃縮去除丙酮后用二氯甲烷萃取除雜,水相用1N HCl調(diào)酸,大量白色固體析出,過濾,濾餅用純化水洗三遍。收集固體用乙酸乙酯/正己烷重結(jié)晶,得到高純度的Fmoc-苯丙氨酸或Fmoc-纈氨酸。

 

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